先進控制系統的安全性體現在其與DCS系統之間的無縫銜接。在DCS系統設置先進控制監視和操作界面是為操作員的操作提供便利，而要實現先進控制系統與DCS系統的無縫銜接，還需要在DCS系統進行更為關鍵的控制邏輯修改。
無縫銜接的控制邏輯主要實現兩種功能：先進控制系統退出、故障或網絡中斷時，DCS系統自動切除先進控制并報警提示；先進控制系統正常運行時，控制模式之間的無擾切換。先進控制組件不斷向DCS系統發送一個不斷變化的心跳信號（如斜坡信號），當先進控制系統退出、故障或網絡中斷時，DCS系統將檢測到此信號消失或者無變化，將自動切除先進控制并向操作員發出報警提示。
各控制回路在DCS控制中一般都有手動和PID自動兩種控制模式，新增先進控制系統后，又增加了先進控制投運和切除兩種控制模式。
先進控制系統可以提高控制回路的控制精度，但在工況不良等特殊情況下，操作員需要還原至常規控制狀態（手動或PID自動）。因此，先進控制系統必須處理好這4種控制模式之間的關系，并且一定要實現無擾切換。
先進控制切除模式與DCS系統的手動、PID自動兩種模式是共存的。
